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澳门太阳娱乐网站官网陈匡时课题组活细胞基因表达可视化技术研究取得新进展
2016.06.03

最近,澳门太阳娱乐网站官网生物医学工程系陈匡时">陈匡时课题组研制出一种能在活细胞中检测单个RNA的分子探针,该研究成果已发表于Biomaterials,题目名为“Single-Molecule Detection and Tracking of RNA Transcripts in Living Cells Using Phosphorothioate-Optimized 2’-O-Methyl RNA Molecular Beacons”。链接:  http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0142961216301958

完全阐明RNA分子在活细胞内的表达、转运和定位,以及它们与疾病发生发展的关系, 至今仍然是一项挑战。MS2-GFP系统是目前在活细胞内检测单分子RNA的主要工具,对于研究细胞生理以及疾病的早期发生与发展机制具有重要的意义。但是该系统具有荧光弱、背景信号高以及分子量大的缺点,对进一步深入研究RNA 在细胞中的功能、活性以及与其它大分子交互作用的贡献有限。另一种可标记RNA的技术——分子信标(molecular beacons, MB),是一种可形成茎环结构的寡核苷酸探针 (图1A),具有能与目的RNA结合后茎结构解离并能释放荧光的特性。然而研究证实, 普遍使用的MB (由DNA 或是2’O-Methyl RNA (2Me) 组成)被导入细胞质后会迅速被细胞核吸收,并被核内的核酸酶降解,引起高达60%的假阳性信号,从而使细胞中的RNA无法被准确地检测(图1B)。


图1:传统分子信标。 A) 分子信标与目的RNA互补的前后变化。B) 无义分子信标在进入细胞后迅速在细胞核中释放假阳性信号

通过优化MB 寡合干酸的化学组成,陈匡时">陈匡时实验室成功研制出具有2Me 以及phosphorothioate (PS) 两种化学修饰的分子信标 (2Me/PSLOOP MB)。该探针具有分子量小 (10,000 Da)、稳定性高、高信号背景比、高准确性、无毒性以及不干扰基因表达等优点,在宽敞显微镜下可检测单一RNA 在细胞核以及细胞质中的动态行为(图2A, B)。新型分子信标技术的应用有望帮助研究者对目的RNA在不同细胞器的表达、转运以及定位进行更深入的阐述。


图2A:细胞中新型分子信标和原位杂交技术(smFISH)在不同时间点的RNA单分子成像比较。图2B:分子信标在活细胞中的细胞核与细胞质单分子示踪mRNA

该工作的第一作者是赵丹。杨艳涛、曲娜、陈明明、马昭等学生为工作的顺利完成做出重要贡献。通讯作者为澳门太阳娱乐网站官网陈匡时">陈匡时特聘研究员。该工作得到了国家自然基金、北京市自然科学基金的资助。